Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc17E9PVB5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ttc17E9PVB5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc17E9PVB5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms