Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgaE9PV24 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms