Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp6ap1lD3Z5W0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp6ap1lD3Z5W0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp6ap1lD3Z5W0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms