Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf1D3YY23 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms