Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Cttnbp2B9EJA2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms