Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam71aB7XG49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms