Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc11B2RXC1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc11B2RXC1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc11B2RXC1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms