Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AU015836B2RUM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AU015836B2RUM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms