Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H60cB1B213 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H60cB1B213 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H60cB1B213 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H60cB1B213 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.1 ms