Protein–RNA interactions for Protein: B1AXH1

Nhsl2, NHS-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl2B1AXH1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nhsl2B1AXH1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nhsl2B1AXH1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhsl2B1AXH1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nhsl2B1AXH1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhsl2B1AXH1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms