Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf25B1AWN9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms