Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930402K13RikB1AW18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930402K13RikB1AW18 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930402K13RikB1AW18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930402K13RikB1AW18 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930402K13RikB1AW18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930402K13RikB1AW18 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930402K13RikB1AW18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4930402K13RikB1AW18 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930402K13RikB1AW18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930402K13RikB1AW18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms