Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc38A3KMP2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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