Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms