Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1jA2BFR3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al1jA2BFR3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms