Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn3aA2ASI5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn3aA2ASI5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms