Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SktA2AQ25 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SktA2AQ25 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SktA2AQ25 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SktA2AQ25 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SktA2AQ25 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SktA2AQ25 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SktA2AQ25 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SktA2AQ25 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SktA2AQ25 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms