Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cavin4A2AMM0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cavin4A2AMM0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cavin4A2AMM0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cavin4A2AMM0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms