Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam43bA2AM80 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fam43bA2AM80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam43bA2AM80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms