Protein–RNA interactions for Protein: A2AJX4

Malrd1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malrd1A2AJX4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Malrd1A2AJX4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Malrd1A2AJX4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Malrd1A2AJX4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Malrd1A2AJX4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Malrd1A2AJX4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Malrd1A2AJX4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Malrd1A2AJX4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Malrd1A2AJX4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Malrd1A2AJX4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Malrd1A2AJX4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Malrd1A2AJX4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Malrd1A2AJX4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms