Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ambra1A2AH22 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ambra1A2AH22 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms