Protein–RNA interactions for Protein: A2A891

Camta1, Calmodulin-binding transcription activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camta1A2A891 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Camta1A2A891 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Camta1A2A891 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Camta1A2A891 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Camta1A2A891 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Camta1A2A891 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Camta1A2A891 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms