Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgap3A2A559 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgap3A2A559 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgap3A2A559 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms