Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm6268A2A3U9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm6268A2A3U9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms