Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L0

Tpbg, Trophoblast glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbgQ9Z0L0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TpbgQ9Z0L0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TpbgQ9Z0L0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TpbgQ9Z0L0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TpbgQ9Z0L0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TpbgQ9Z0L0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TpbgQ9Z0L0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TpbgQ9Z0L0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TpbgQ9Z0L0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TpbgQ9Z0L0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TpbgQ9Z0L0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TpbgQ9Z0L0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TpbgQ9Z0L0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TpbgQ9Z0L0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TpbgQ9Z0L0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TpbgQ9Z0L0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TpbgQ9Z0L0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TpbgQ9Z0L0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TpbgQ9Z0L0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TpbgQ9Z0L0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TpbgQ9Z0L0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TpbgQ9Z0L0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TpbgQ9Z0L0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TpbgQ9Z0L0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TpbgQ9Z0L0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TpbgQ9Z0L0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TpbgQ9Z0L0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TpbgQ9Z0L0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TpbgQ9Z0L0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TpbgQ9Z0L0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TpbgQ9Z0L0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TpbgQ9Z0L0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TpbgQ9Z0L0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TpbgQ9Z0L0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TpbgQ9Z0L0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TpbgQ9Z0L0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TpbgQ9Z0L0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TpbgQ9Z0L0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TpbgQ9Z0L0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TpbgQ9Z0L0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TpbgQ9Z0L0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TpbgQ9Z0L0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TpbgQ9Z0L0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TpbgQ9Z0L0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TpbgQ9Z0L0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TpbgQ9Z0L0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TpbgQ9Z0L0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TpbgQ9Z0L0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TpbgQ9Z0L0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TpbgQ9Z0L0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TpbgQ9Z0L0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TpbgQ9Z0L0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TpbgQ9Z0L0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TpbgQ9Z0L0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TpbgQ9Z0L0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TpbgQ9Z0L0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TpbgQ9Z0L0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TpbgQ9Z0L0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TpbgQ9Z0L0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TpbgQ9Z0L0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TpbgQ9Z0L0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TpbgQ9Z0L0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TpbgQ9Z0L0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TpbgQ9Z0L0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TpbgQ9Z0L0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TpbgQ9Z0L0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TpbgQ9Z0L0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TpbgQ9Z0L0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TpbgQ9Z0L0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TpbgQ9Z0L0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TpbgQ9Z0L0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TpbgQ9Z0L0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TpbgQ9Z0L0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TpbgQ9Z0L0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TpbgQ9Z0L0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TpbgQ9Z0L0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TpbgQ9Z0L0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TpbgQ9Z0L0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TpbgQ9Z0L0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TpbgQ9Z0L0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TpbgQ9Z0L0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TpbgQ9Z0L0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TpbgQ9Z0L0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms