Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB0

Rbpms, RNA-binding protein with multiple splicing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbpmsQ9WVB0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RbpmsQ9WVB0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RbpmsQ9WVB0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RbpmsQ9WVB0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RbpmsQ9WVB0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RbpmsQ9WVB0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RbpmsQ9WVB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RbpmsQ9WVB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RbpmsQ9WVB0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RbpmsQ9WVB0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RbpmsQ9WVB0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RbpmsQ9WVB0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RbpmsQ9WVB0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RbpmsQ9WVB0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RbpmsQ9WVB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RbpmsQ9WVB0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RbpmsQ9WVB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RbpmsQ9WVB0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RbpmsQ9WVB0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RbpmsQ9WVB0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RbpmsQ9WVB0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RbpmsQ9WVB0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbpmsQ9WVB0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RbpmsQ9WVB0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RbpmsQ9WVB0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbpmsQ9WVB0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbpmsQ9WVB0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbpmsQ9WVB0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbpmsQ9WVB0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbpmsQ9WVB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbpmsQ9WVB0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbpmsQ9WVB0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RbpmsQ9WVB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RbpmsQ9WVB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RbpmsQ9WVB0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RbpmsQ9WVB0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RbpmsQ9WVB0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RbpmsQ9WVB0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RbpmsQ9WVB0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RbpmsQ9WVB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RbpmsQ9WVB0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RbpmsQ9WVB0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RbpmsQ9WVB0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbpmsQ9WVB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbpmsQ9WVB0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbpmsQ9WVB0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RbpmsQ9WVB0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RbpmsQ9WVB0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RbpmsQ9WVB0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RbpmsQ9WVB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbpmsQ9WVB0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RbpmsQ9WVB0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbpmsQ9WVB0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RbpmsQ9WVB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RbpmsQ9WVB0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RbpmsQ9WVB0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RbpmsQ9WVB0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RbpmsQ9WVB0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbpmsQ9WVB0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbpmsQ9WVB0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbpmsQ9WVB0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbpmsQ9WVB0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbpmsQ9WVB0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbpmsQ9WVB0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RbpmsQ9WVB0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbpmsQ9WVB0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbpmsQ9WVB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbpmsQ9WVB0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbpmsQ9WVB0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbpmsQ9WVB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbpmsQ9WVB0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbpmsQ9WVB0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RbpmsQ9WVB0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbpmsQ9WVB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbpmsQ9WVB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbpmsQ9WVB0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbpmsQ9WVB0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RbpmsQ9WVB0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RbpmsQ9WVB0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RbpmsQ9WVB0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RbpmsQ9WVB0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RbpmsQ9WVB0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RbpmsQ9WVB0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RbpmsQ9WVB0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbpmsQ9WVB0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbpmsQ9WVB0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RbpmsQ9WVB0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RbpmsQ9WVB0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RbpmsQ9WVB0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RbpmsQ9WVB0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms