Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,69■□□□□ 0,9
CcsQ9WU84 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
CcsQ9WU84 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
CcsQ9WU84 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
CcsQ9WU84 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
CcsQ9WU84 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
CcsQ9WU84 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
CcsQ9WU84 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
CcsQ9WU84 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
CcsQ9WU84 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
CcsQ9WU84 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,6■□□□□ 0,89
CcsQ9WU84 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
CcsQ9WU84 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,59■□□□□ 0,89
CcsQ9WU84 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
CcsQ9WU84 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
CcsQ9WU84 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
CcsQ9WU84 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
CcsQ9WU84 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
CcsQ9WU84 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
CcsQ9WU84 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
CcsQ9WU84 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
CcsQ9WU84 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
CcsQ9WU84 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,47■□□□□ 0,87
CcsQ9WU84 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
CcsQ9WU84 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
CcsQ9WU84 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
CcsQ9WU84 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
CcsQ9WU84 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
CcsQ9WU84 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,39■□□□□ 0,85
CcsQ9WU84 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
CcsQ9WU84 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,37■□□□□ 0,85
CcsQ9WU84 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
CcsQ9WU84 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
CcsQ9WU84 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,32■□□□□ 0,84
CcsQ9WU84 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
CcsQ9WU84 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
CcsQ9WU84 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
CcsQ9WU84 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
CcsQ9WU84 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
CcsQ9WU84 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
CcsQ9WU84 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
CcsQ9WU84 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
CcsQ9WU84 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
CcsQ9WU84 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
CcsQ9WU84 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
CcsQ9WU84 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
CcsQ9WU84 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,15■□□□□ 0,82
CcsQ9WU84 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
CcsQ9WU84 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
CcsQ9WU84 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,13■□□□□ 0,81
CcsQ9WU84 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
CcsQ9WU84 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20,11■□□□□ 0,81
CcsQ9WU84 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
CcsQ9WU84 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
CcsQ9WU84 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
CcsQ9WU84 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,06■□□□□ 0,8
CcsQ9WU84 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
CcsQ9WU84 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,05■□□□□ 0,8
CcsQ9WU84 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,03■□□□□ 0,8
CcsQ9WU84 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
CcsQ9WU84 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
CcsQ9WU84 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
CcsQ9WU84 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
CcsQ9WU84 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
CcsQ9WU84 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
CcsQ9WU84 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
CcsQ9WU84 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
CcsQ9WU84 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
CcsQ9WU84 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
CcsQ9WU84 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
CcsQ9WU84 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
CcsQ9WU84 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
CcsQ9WU84 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
CcsQ9WU84 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
CcsQ9WU84 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19,91■□□□□ 0,78
CcsQ9WU84 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
CcsQ9WU84 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
CcsQ9WU84 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19,86■□□□□ 0,77
CcsQ9WU84 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
CcsQ9WU84 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19,84■□□□□ 0,77
CcsQ9WU84 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
CcsQ9WU84 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
CcsQ9WU84 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
CcsQ9WU84 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19,78■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19,77■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19,77■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19,77■□□□□ 0,76
CcsQ9WU84 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
CcsQ9WU84 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
CcsQ9WU84 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,8 ms