Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus1Q9WU56 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus1Q9WU56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus1Q9WU56 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus1Q9WU56 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus1Q9WU56 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus1Q9WU56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus1Q9WU56 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus1Q9WU56 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus1Q9WU56 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus1Q9WU56 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus1Q9WU56 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus1Q9WU56 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus1Q9WU56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus1Q9WU56 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus1Q9WU56 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus1Q9WU56 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus1Q9WU56 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus1Q9WU56 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus1Q9WU56 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus1Q9WU56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pus1Q9WU56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pus1Q9WU56 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pus1Q9WU56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pus1Q9WU56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pus1Q9WU56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pus1Q9WU56 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus1Q9WU56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus1Q9WU56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pus1Q9WU56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pus1Q9WU56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pus1Q9WU56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pus1Q9WU56 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pus1Q9WU56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pus1Q9WU56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pus1Q9WU56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pus1Q9WU56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pus1Q9WU56 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pus1Q9WU56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus1Q9WU56 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus1Q9WU56 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus1Q9WU56 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus1Q9WU56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus1Q9WU56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus1Q9WU56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus1Q9WU56 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus1Q9WU56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus1Q9WU56 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus1Q9WU56 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus1Q9WU56 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus1Q9WU56 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus1Q9WU56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pus1Q9WU56 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus1Q9WU56 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus1Q9WU56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus1Q9WU56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pus1Q9WU56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pus1Q9WU56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pus1Q9WU56 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pus1Q9WU56 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus1Q9WU56 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus1Q9WU56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus1Q9WU56 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus1Q9WU56 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus1Q9WU56 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus1Q9WU56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus1Q9WU56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus1Q9WU56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus1Q9WU56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus1Q9WU56 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus1Q9WU56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus1Q9WU56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus1Q9WU56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus1Q9WU56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus1Q9WU56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus1Q9WU56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pus1Q9WU56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pus1Q9WU56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pus1Q9WU56 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus1Q9WU56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus1Q9WU56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus1Q9WU56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus1Q9WU56 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus1Q9WU56 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus1Q9WU56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus1Q9WU56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus1Q9WU56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus1Q9WU56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus1Q9WU56 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus1Q9WU56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus1Q9WU56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus1Q9WU56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms