Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nubp2Q9R061 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nubp2Q9R061 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nubp2Q9R061 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nubp2Q9R061 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nubp2Q9R061 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nubp2Q9R061 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nubp2Q9R061 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nubp2Q9R061 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nubp2Q9R061 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nubp2Q9R061 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nubp2Q9R061 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nubp2Q9R061 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nubp2Q9R061 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nubp2Q9R061 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nubp2Q9R061 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nubp2Q9R061 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nubp2Q9R061 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nubp2Q9R061 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nubp2Q9R061 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nubp2Q9R061 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nubp2Q9R061 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nubp2Q9R061 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nubp2Q9R061 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nubp2Q9R061 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nubp2Q9R061 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nubp2Q9R061 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nubp2Q9R061 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nubp2Q9R061 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nubp2Q9R061 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nubp2Q9R061 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nubp2Q9R061 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nubp2Q9R061 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nubp2Q9R061 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nubp2Q9R061 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nubp2Q9R061 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nubp2Q9R061 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nubp2Q9R061 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nubp2Q9R061 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nubp2Q9R061 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nubp2Q9R061 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nubp2Q9R061 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nubp2Q9R061 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nubp2Q9R061 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nubp2Q9R061 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nubp2Q9R061 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nubp2Q9R061 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nubp2Q9R061 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nubp2Q9R061 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nubp2Q9R061 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nubp2Q9R061 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nubp2Q9R061 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nubp2Q9R061 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nubp2Q9R061 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nubp2Q9R061 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nubp2Q9R061 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nubp2Q9R061 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nubp2Q9R061 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nubp2Q9R061 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nubp2Q9R061 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nubp2Q9R061 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nubp2Q9R061 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nubp2Q9R061 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nubp2Q9R061 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nubp2Q9R061 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nubp2Q9R061 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms