Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cnpy2Q9QXT0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cnpy2Q9QXT0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cnpy2Q9QXT0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cnpy2Q9QXT0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cnpy2Q9QXT0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cnpy2Q9QXT0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cnpy2Q9QXT0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cnpy2Q9QXT0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cnpy2Q9QXT0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Cnpy2Q9QXT0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cnpy2Q9QXT0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cnpy2Q9QXT0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cnpy2Q9QXT0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Cnpy2Q9QXT0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cnpy2Q9QXT0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cnpy2Q9QXT0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cnpy2Q9QXT0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cnpy2Q9QXT0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cnpy2Q9QXT0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cnpy2Q9QXT0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cnpy2Q9QXT0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cnpy2Q9QXT0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cnpy2Q9QXT0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cnpy2Q9QXT0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cnpy2Q9QXT0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cnpy2Q9QXT0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cnpy2Q9QXT0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cnpy2Q9QXT0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cnpy2Q9QXT0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cnpy2Q9QXT0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cnpy2Q9QXT0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cnpy2Q9QXT0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cnpy2Q9QXT0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cnpy2Q9QXT0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cnpy2Q9QXT0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cnpy2Q9QXT0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnpy2Q9QXT0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Cnpy2Q9QXT0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cnpy2Q9QXT0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cnpy2Q9QXT0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cnpy2Q9QXT0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cnpy2Q9QXT0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cnpy2Q9QXT0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cnpy2Q9QXT0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cnpy2Q9QXT0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cnpy2Q9QXT0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cnpy2Q9QXT0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cnpy2Q9QXT0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cnpy2Q9QXT0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cnpy2Q9QXT0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnpy2Q9QXT0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cnpy2Q9QXT0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cnpy2Q9QXT0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Cnpy2Q9QXT0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cnpy2Q9QXT0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cnpy2Q9QXT0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cnpy2Q9QXT0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cnpy2Q9QXT0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnpy2Q9QXT0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnpy2Q9QXT0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cnpy2Q9QXT0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cnpy2Q9QXT0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cnpy2Q9QXT0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cnpy2Q9QXT0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnpy2Q9QXT0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnpy2Q9QXT0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cnpy2Q9QXT0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cnpy2Q9QXT0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cnpy2Q9QXT0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnpy2Q9QXT0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnpy2Q9QXT0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnpy2Q9QXT0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnpy2Q9QXT0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cnpy2Q9QXT0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cnpy2Q9QXT0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cnpy2Q9QXT0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnpy2Q9QXT0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnpy2Q9QXT0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnpy2Q9QXT0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cnpy2Q9QXT0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnpy2Q9QXT0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cnpy2Q9QXT0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cnpy2Q9QXT0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnpy2Q9QXT0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cnpy2Q9QXT0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cnpy2Q9QXT0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnpy2Q9QXT0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cnpy2Q9QXT0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cnpy2Q9QXT0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cnpy2Q9QXT0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cnpy2Q9QXT0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cnpy2Q9QXT0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cnpy2Q9QXT0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnpy2Q9QXT0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnpy2Q9QXT0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms