Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1ql3Q9ESN4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1ql3Q9ESN4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1ql3Q9ESN4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1ql3Q9ESN4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1ql3Q9ESN4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1ql3Q9ESN4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1ql3Q9ESN4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1ql3Q9ESN4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1ql3Q9ESN4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1ql3Q9ESN4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1ql3Q9ESN4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1ql3Q9ESN4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1ql3Q9ESN4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1ql3Q9ESN4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C1ql3Q9ESN4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1ql3Q9ESN4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1ql3Q9ESN4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1ql3Q9ESN4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C1ql3Q9ESN4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1ql3Q9ESN4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1ql3Q9ESN4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1ql3Q9ESN4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1ql3Q9ESN4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1ql3Q9ESN4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1ql3Q9ESN4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1ql3Q9ESN4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1ql3Q9ESN4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1ql3Q9ESN4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1ql3Q9ESN4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1ql3Q9ESN4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1ql3Q9ESN4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1ql3Q9ESN4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1ql3Q9ESN4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C1ql3Q9ESN4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1ql3Q9ESN4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1ql3Q9ESN4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1ql3Q9ESN4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1ql3Q9ESN4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1ql3Q9ESN4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1ql3Q9ESN4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1ql3Q9ESN4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1ql3Q9ESN4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1ql3Q9ESN4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C1ql3Q9ESN4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1ql3Q9ESN4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1ql3Q9ESN4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1ql3Q9ESN4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1ql3Q9ESN4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C1ql3Q9ESN4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1ql3Q9ESN4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1ql3Q9ESN4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1ql3Q9ESN4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1ql3Q9ESN4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1ql3Q9ESN4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1ql3Q9ESN4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1ql3Q9ESN4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1ql3Q9ESN4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1ql3Q9ESN4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1ql3Q9ESN4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1ql3Q9ESN4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1ql3Q9ESN4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1ql3Q9ESN4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1ql3Q9ESN4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1ql3Q9ESN4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1ql3Q9ESN4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1ql3Q9ESN4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1ql3Q9ESN4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1ql3Q9ESN4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1ql3Q9ESN4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1ql3Q9ESN4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1ql3Q9ESN4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1ql3Q9ESN4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1ql3Q9ESN4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1ql3Q9ESN4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C1ql3Q9ESN4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C1ql3Q9ESN4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1ql3Q9ESN4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1ql3Q9ESN4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1ql3Q9ESN4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1ql3Q9ESN4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1ql3Q9ESN4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1ql3Q9ESN4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1ql3Q9ESN4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1ql3Q9ESN4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1ql3Q9ESN4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1ql3Q9ESN4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1ql3Q9ESN4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1ql3Q9ESN4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1ql3Q9ESN4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1ql3Q9ESN4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1ql3Q9ESN4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1ql3Q9ESN4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1ql3Q9ESN4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1ql3Q9ESN4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1ql3Q9ESN4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1ql3Q9ESN4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1ql3Q9ESN4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1ql3Q9ESN4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1ql3Q9ESN4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms