Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hipk3Q9ERH7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hipk3Q9ERH7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hipk3Q9ERH7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hipk3Q9ERH7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hipk3Q9ERH7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hipk3Q9ERH7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hipk3Q9ERH7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hipk3Q9ERH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hipk3Q9ERH7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hipk3Q9ERH7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hipk3Q9ERH7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hipk3Q9ERH7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hipk3Q9ERH7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hipk3Q9ERH7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hipk3Q9ERH7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hipk3Q9ERH7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hipk3Q9ERH7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hipk3Q9ERH7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hipk3Q9ERH7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hipk3Q9ERH7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hipk3Q9ERH7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hipk3Q9ERH7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hipk3Q9ERH7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hipk3Q9ERH7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hipk3Q9ERH7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hipk3Q9ERH7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hipk3Q9ERH7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hipk3Q9ERH7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hipk3Q9ERH7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hipk3Q9ERH7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hipk3Q9ERH7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hipk3Q9ERH7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hipk3Q9ERH7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hipk3Q9ERH7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hipk3Q9ERH7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hipk3Q9ERH7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hipk3Q9ERH7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hipk3Q9ERH7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hipk3Q9ERH7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hipk3Q9ERH7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hipk3Q9ERH7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hipk3Q9ERH7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hipk3Q9ERH7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hipk3Q9ERH7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hipk3Q9ERH7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hipk3Q9ERH7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hipk3Q9ERH7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hipk3Q9ERH7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hipk3Q9ERH7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hipk3Q9ERH7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hipk3Q9ERH7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hipk3Q9ERH7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hipk3Q9ERH7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hipk3Q9ERH7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hipk3Q9ERH7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hipk3Q9ERH7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hipk3Q9ERH7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hipk3Q9ERH7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hipk3Q9ERH7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hipk3Q9ERH7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hipk3Q9ERH7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hipk3Q9ERH7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hipk3Q9ERH7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hipk3Q9ERH7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hipk3Q9ERH7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hipk3Q9ERH7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hipk3Q9ERH7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hipk3Q9ERH7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hipk3Q9ERH7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hipk3Q9ERH7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hipk3Q9ERH7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hipk3Q9ERH7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hipk3Q9ERH7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hipk3Q9ERH7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hipk3Q9ERH7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hipk3Q9ERH7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hipk3Q9ERH7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hipk3Q9ERH7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hipk3Q9ERH7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hipk3Q9ERH7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hipk3Q9ERH7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hipk3Q9ERH7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hipk3Q9ERH7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms