Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlnrd1Q9ERE8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlnrd1Q9ERE8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlnrd1Q9ERE8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlnrd1Q9ERE8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlnrd1Q9ERE8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlnrd1Q9ERE8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlnrd1Q9ERE8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlnrd1Q9ERE8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlnrd1Q9ERE8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlnrd1Q9ERE8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlnrd1Q9ERE8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlnrd1Q9ERE8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlnrd1Q9ERE8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlnrd1Q9ERE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlnrd1Q9ERE8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlnrd1Q9ERE8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlnrd1Q9ERE8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlnrd1Q9ERE8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlnrd1Q9ERE8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlnrd1Q9ERE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlnrd1Q9ERE8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlnrd1Q9ERE8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlnrd1Q9ERE8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlnrd1Q9ERE8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlnrd1Q9ERE8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlnrd1Q9ERE8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlnrd1Q9ERE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlnrd1Q9ERE8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlnrd1Q9ERE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlnrd1Q9ERE8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlnrd1Q9ERE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlnrd1Q9ERE8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlnrd1Q9ERE8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlnrd1Q9ERE8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlnrd1Q9ERE8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlnrd1Q9ERE8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlnrd1Q9ERE8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlnrd1Q9ERE8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlnrd1Q9ERE8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlnrd1Q9ERE8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlnrd1Q9ERE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlnrd1Q9ERE8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlnrd1Q9ERE8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlnrd1Q9ERE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlnrd1Q9ERE8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlnrd1Q9ERE8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlnrd1Q9ERE8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlnrd1Q9ERE8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlnrd1Q9ERE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlnrd1Q9ERE8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlnrd1Q9ERE8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlnrd1Q9ERE8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlnrd1Q9ERE8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlnrd1Q9ERE8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlnrd1Q9ERE8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlnrd1Q9ERE8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlnrd1Q9ERE8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlnrd1Q9ERE8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlnrd1Q9ERE8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlnrd1Q9ERE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlnrd1Q9ERE8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlnrd1Q9ERE8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlnrd1Q9ERE8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlnrd1Q9ERE8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlnrd1Q9ERE8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlnrd1Q9ERE8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlnrd1Q9ERE8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms