Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM4

Dnal4, Dynein light chain 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal4Q9DCM4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal4Q9DCM4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnal4Q9DCM4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnal4Q9DCM4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnal4Q9DCM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnal4Q9DCM4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnal4Q9DCM4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal4Q9DCM4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal4Q9DCM4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnal4Q9DCM4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnal4Q9DCM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnal4Q9DCM4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnal4Q9DCM4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnal4Q9DCM4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnal4Q9DCM4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnal4Q9DCM4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnal4Q9DCM4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnal4Q9DCM4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnal4Q9DCM4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnal4Q9DCM4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnal4Q9DCM4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnal4Q9DCM4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnal4Q9DCM4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnal4Q9DCM4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal4Q9DCM4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnal4Q9DCM4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal4Q9DCM4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnal4Q9DCM4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal4Q9DCM4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnal4Q9DCM4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnal4Q9DCM4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal4Q9DCM4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal4Q9DCM4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal4Q9DCM4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal4Q9DCM4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal4Q9DCM4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal4Q9DCM4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal4Q9DCM4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal4Q9DCM4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal4Q9DCM4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal4Q9DCM4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnal4Q9DCM4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnal4Q9DCM4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnal4Q9DCM4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnal4Q9DCM4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnal4Q9DCM4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnal4Q9DCM4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnal4Q9DCM4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnal4Q9DCM4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnal4Q9DCM4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal4Q9DCM4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal4Q9DCM4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal4Q9DCM4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal4Q9DCM4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal4Q9DCM4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal4Q9DCM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal4Q9DCM4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnal4Q9DCM4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal4Q9DCM4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal4Q9DCM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal4Q9DCM4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal4Q9DCM4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal4Q9DCM4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal4Q9DCM4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms