Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Riok3Q9DBU3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Riok3Q9DBU3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Riok3Q9DBU3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Riok3Q9DBU3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Riok3Q9DBU3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Riok3Q9DBU3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Riok3Q9DBU3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Riok3Q9DBU3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Riok3Q9DBU3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Riok3Q9DBU3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Riok3Q9DBU3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Riok3Q9DBU3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Riok3Q9DBU3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Riok3Q9DBU3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Riok3Q9DBU3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Riok3Q9DBU3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Riok3Q9DBU3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Riok3Q9DBU3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Riok3Q9DBU3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Riok3Q9DBU3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Riok3Q9DBU3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Riok3Q9DBU3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Riok3Q9DBU3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Riok3Q9DBU3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Riok3Q9DBU3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Riok3Q9DBU3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Riok3Q9DBU3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Riok3Q9DBU3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Riok3Q9DBU3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Riok3Q9DBU3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Riok3Q9DBU3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Riok3Q9DBU3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Riok3Q9DBU3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Riok3Q9DBU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Riok3Q9DBU3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Riok3Q9DBU3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Riok3Q9DBU3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Riok3Q9DBU3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Riok3Q9DBU3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Riok3Q9DBU3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Riok3Q9DBU3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Riok3Q9DBU3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Riok3Q9DBU3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Riok3Q9DBU3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Riok3Q9DBU3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Riok3Q9DBU3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Riok3Q9DBU3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Riok3Q9DBU3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Riok3Q9DBU3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Riok3Q9DBU3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Riok3Q9DBU3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Riok3Q9DBU3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Riok3Q9DBU3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Riok3Q9DBU3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Riok3Q9DBU3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Riok3Q9DBU3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Riok3Q9DBU3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Riok3Q9DBU3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Riok3Q9DBU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Riok3Q9DBU3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Riok3Q9DBU3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Riok3Q9DBU3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Riok3Q9DBU3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok3Q9DBU3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Riok3Q9DBU3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Riok3Q9DBU3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Riok3Q9DBU3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Riok3Q9DBU3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Riok3Q9DBU3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Riok3Q9DBU3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Riok3Q9DBU3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Riok3Q9DBU3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Riok3Q9DBU3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Riok3Q9DBU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Riok3Q9DBU3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Riok3Q9DBU3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Riok3Q9DBU3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Riok3Q9DBU3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Riok3Q9DBU3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Riok3Q9DBU3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Riok3Q9DBU3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Riok3Q9DBU3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms