Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lin37Q9D8N6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lin37Q9D8N6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lin37Q9D8N6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lin37Q9D8N6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lin37Q9D8N6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lin37Q9D8N6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lin37Q9D8N6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lin37Q9D8N6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lin37Q9D8N6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lin37Q9D8N6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lin37Q9D8N6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lin37Q9D8N6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lin37Q9D8N6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lin37Q9D8N6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lin37Q9D8N6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lin37Q9D8N6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lin37Q9D8N6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lin37Q9D8N6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lin37Q9D8N6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lin37Q9D8N6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lin37Q9D8N6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lin37Q9D8N6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin37Q9D8N6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin37Q9D8N6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin37Q9D8N6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin37Q9D8N6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin37Q9D8N6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin37Q9D8N6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin37Q9D8N6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lin37Q9D8N6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lin37Q9D8N6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lin37Q9D8N6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lin37Q9D8N6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lin37Q9D8N6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lin37Q9D8N6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lin37Q9D8N6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lin37Q9D8N6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lin37Q9D8N6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lin37Q9D8N6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lin37Q9D8N6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lin37Q9D8N6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lin37Q9D8N6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lin37Q9D8N6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lin37Q9D8N6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lin37Q9D8N6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lin37Q9D8N6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lin37Q9D8N6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lin37Q9D8N6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lin37Q9D8N6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lin37Q9D8N6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lin37Q9D8N6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lin37Q9D8N6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lin37Q9D8N6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lin37Q9D8N6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lin37Q9D8N6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lin37Q9D8N6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lin37Q9D8N6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lin37Q9D8N6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lin37Q9D8N6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lin37Q9D8N6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lin37Q9D8N6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lin37Q9D8N6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lin37Q9D8N6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lin37Q9D8N6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lin37Q9D8N6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lin37Q9D8N6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lin37Q9D8N6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin37Q9D8N6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin37Q9D8N6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin37Q9D8N6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin37Q9D8N6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin37Q9D8N6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lin37Q9D8N6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin37Q9D8N6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin37Q9D8N6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin37Q9D8N6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin37Q9D8N6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin37Q9D8N6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin37Q9D8N6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin37Q9D8N6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin37Q9D8N6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms