Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn23Q9D7D7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn23Q9D7D7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn23Q9D7D7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn23Q9D7D7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn23Q9D7D7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn23Q9D7D7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn23Q9D7D7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn23Q9D7D7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn23Q9D7D7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn23Q9D7D7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn23Q9D7D7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn23Q9D7D7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn23Q9D7D7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn23Q9D7D7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn23Q9D7D7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn23Q9D7D7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn23Q9D7D7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn23Q9D7D7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn23Q9D7D7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn23Q9D7D7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn23Q9D7D7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn23Q9D7D7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn23Q9D7D7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn23Q9D7D7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn23Q9D7D7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn23Q9D7D7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn23Q9D7D7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn23Q9D7D7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn23Q9D7D7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn23Q9D7D7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn23Q9D7D7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn23Q9D7D7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn23Q9D7D7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn23Q9D7D7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn23Q9D7D7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn23Q9D7D7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cldn23Q9D7D7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn23Q9D7D7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn23Q9D7D7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn23Q9D7D7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn23Q9D7D7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn23Q9D7D7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn23Q9D7D7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn23Q9D7D7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn23Q9D7D7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn23Q9D7D7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn23Q9D7D7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn23Q9D7D7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn23Q9D7D7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn23Q9D7D7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn23Q9D7D7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn23Q9D7D7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn23Q9D7D7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn23Q9D7D7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn23Q9D7D7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn23Q9D7D7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn23Q9D7D7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn23Q9D7D7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn23Q9D7D7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn23Q9D7D7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn23Q9D7D7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn23Q9D7D7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn23Q9D7D7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn23Q9D7D7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn23Q9D7D7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn23Q9D7D7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn23Q9D7D7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn23Q9D7D7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn23Q9D7D7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn23Q9D7D7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn23Q9D7D7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn23Q9D7D7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn23Q9D7D7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn23Q9D7D7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn23Q9D7D7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn23Q9D7D7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn23Q9D7D7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn23Q9D7D7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn23Q9D7D7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn23Q9D7D7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn23Q9D7D7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn23Q9D7D7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn23Q9D7D7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn23Q9D7D7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn23Q9D7D7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn23Q9D7D7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn23Q9D7D7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn23Q9D7D7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn23Q9D7D7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn23Q9D7D7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn23Q9D7D7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn23Q9D7D7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn23Q9D7D7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn23Q9D7D7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn23Q9D7D7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn23Q9D7D7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn23Q9D7D7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms