Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Hddc3Q9D114 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hddc3Q9D114 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hddc3Q9D114 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hddc3Q9D114 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hddc3Q9D114 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hddc3Q9D114 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hddc3Q9D114 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hddc3Q9D114 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hddc3Q9D114 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hddc3Q9D114 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hddc3Q9D114 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hddc3Q9D114 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hddc3Q9D114 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hddc3Q9D114 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hddc3Q9D114 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hddc3Q9D114 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hddc3Q9D114 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hddc3Q9D114 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hddc3Q9D114 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hddc3Q9D114 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hddc3Q9D114 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hddc3Q9D114 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hddc3Q9D114 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hddc3Q9D114 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hddc3Q9D114 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hddc3Q9D114 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hddc3Q9D114 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hddc3Q9D114 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hddc3Q9D114 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Hddc3Q9D114 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hddc3Q9D114 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hddc3Q9D114 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hddc3Q9D114 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hddc3Q9D114 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hddc3Q9D114 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hddc3Q9D114 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hddc3Q9D114 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Hddc3Q9D114 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hddc3Q9D114 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hddc3Q9D114 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hddc3Q9D114 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hddc3Q9D114 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hddc3Q9D114 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hddc3Q9D114 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hddc3Q9D114 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hddc3Q9D114 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hddc3Q9D114 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hddc3Q9D114 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hddc3Q9D114 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Hddc3Q9D114 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hddc3Q9D114 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hddc3Q9D114 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hddc3Q9D114 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hddc3Q9D114 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hddc3Q9D114 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hddc3Q9D114 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hddc3Q9D114 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hddc3Q9D114 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hddc3Q9D114 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hddc3Q9D114 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hddc3Q9D114 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hddc3Q9D114 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Hddc3Q9D114 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hddc3Q9D114 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hddc3Q9D114 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hddc3Q9D114 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hddc3Q9D114 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hddc3Q9D114 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hddc3Q9D114 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hddc3Q9D114 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hddc3Q9D114 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hddc3Q9D114 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hddc3Q9D114 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hddc3Q9D114 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Hddc3Q9D114 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hddc3Q9D114 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hddc3Q9D114 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hddc3Q9D114 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hddc3Q9D114 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hddc3Q9D114 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hddc3Q9D114 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hddc3Q9D114 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hddc3Q9D114 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hddc3Q9D114 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hddc3Q9D114 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hddc3Q9D114 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hddc3Q9D114 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hddc3Q9D114 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hddc3Q9D114 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hddc3Q9D114 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hddc3Q9D114 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hddc3Q9D114 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hddc3Q9D114 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hddc3Q9D114 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hddc3Q9D114 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hddc3Q9D114 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hddc3Q9D114 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hddc3Q9D114 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Hddc3Q9D114 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms