Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nde1Q9CZA6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nde1Q9CZA6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nde1Q9CZA6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nde1Q9CZA6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nde1Q9CZA6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nde1Q9CZA6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nde1Q9CZA6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nde1Q9CZA6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nde1Q9CZA6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nde1Q9CZA6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nde1Q9CZA6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nde1Q9CZA6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nde1Q9CZA6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nde1Q9CZA6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nde1Q9CZA6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nde1Q9CZA6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nde1Q9CZA6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nde1Q9CZA6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nde1Q9CZA6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nde1Q9CZA6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nde1Q9CZA6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nde1Q9CZA6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nde1Q9CZA6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nde1Q9CZA6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nde1Q9CZA6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nde1Q9CZA6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nde1Q9CZA6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nde1Q9CZA6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nde1Q9CZA6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nde1Q9CZA6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nde1Q9CZA6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nde1Q9CZA6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nde1Q9CZA6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nde1Q9CZA6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nde1Q9CZA6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nde1Q9CZA6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nde1Q9CZA6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nde1Q9CZA6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nde1Q9CZA6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nde1Q9CZA6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nde1Q9CZA6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nde1Q9CZA6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nde1Q9CZA6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nde1Q9CZA6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nde1Q9CZA6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nde1Q9CZA6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nde1Q9CZA6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nde1Q9CZA6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nde1Q9CZA6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nde1Q9CZA6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nde1Q9CZA6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nde1Q9CZA6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nde1Q9CZA6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nde1Q9CZA6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nde1Q9CZA6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nde1Q9CZA6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nde1Q9CZA6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nde1Q9CZA6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nde1Q9CZA6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nde1Q9CZA6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nde1Q9CZA6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nde1Q9CZA6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nde1Q9CZA6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nde1Q9CZA6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nde1Q9CZA6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nde1Q9CZA6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nde1Q9CZA6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nde1Q9CZA6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nde1Q9CZA6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nde1Q9CZA6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nde1Q9CZA6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nde1Q9CZA6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nde1Q9CZA6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nde1Q9CZA6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nde1Q9CZA6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nde1Q9CZA6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nde1Q9CZA6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nde1Q9CZA6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nde1Q9CZA6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nde1Q9CZA6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nde1Q9CZA6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nde1Q9CZA6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nde1Q9CZA6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms