Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX48

Zcchc10, Zinc finger CCHC domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc10Q9CX48 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc10Q9CX48 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc10Q9CX48 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc10Q9CX48 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc10Q9CX48 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc10Q9CX48 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc10Q9CX48 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc10Q9CX48 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc10Q9CX48 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc10Q9CX48 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc10Q9CX48 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc10Q9CX48 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc10Q9CX48 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc10Q9CX48 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc10Q9CX48 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc10Q9CX48 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc10Q9CX48 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc10Q9CX48 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc10Q9CX48 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc10Q9CX48 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc10Q9CX48 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zcchc10Q9CX48 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc10Q9CX48 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc10Q9CX48 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc10Q9CX48 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc10Q9CX48 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc10Q9CX48 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zcchc10Q9CX48 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc10Q9CX48 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc10Q9CX48 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc10Q9CX48 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc10Q9CX48 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc10Q9CX48 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc10Q9CX48 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc10Q9CX48 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc10Q9CX48 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc10Q9CX48 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc10Q9CX48 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc10Q9CX48 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc10Q9CX48 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc10Q9CX48 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc10Q9CX48 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc10Q9CX48 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc10Q9CX48 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc10Q9CX48 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc10Q9CX48 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc10Q9CX48 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc10Q9CX48 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc10Q9CX48 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc10Q9CX48 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc10Q9CX48 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc10Q9CX48 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc10Q9CX48 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc10Q9CX48 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc10Q9CX48 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc10Q9CX48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc10Q9CX48 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc10Q9CX48 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc10Q9CX48 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc10Q9CX48 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc10Q9CX48 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc10Q9CX48 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zcchc10Q9CX48 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc10Q9CX48 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc10Q9CX48 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc10Q9CX48 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc10Q9CX48 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc10Q9CX48 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc10Q9CX48 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc10Q9CX48 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc10Q9CX48 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc10Q9CX48 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc10Q9CX48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc10Q9CX48 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc10Q9CX48 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc10Q9CX48 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc10Q9CX48 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc10Q9CX48 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc10Q9CX48 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc10Q9CX48 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc10Q9CX48 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc10Q9CX48 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc10Q9CX48 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc10Q9CX48 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc10Q9CX48 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc10Q9CX48 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc10Q9CX48 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc10Q9CX48 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc10Q9CX48 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc10Q9CX48 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc10Q9CX48 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc10Q9CX48 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.3 ms