Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp23Q9CX11 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp23Q9CX11 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Utp23Q9CX11 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Utp23Q9CX11 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp23Q9CX11 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp23Q9CX11 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp23Q9CX11 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Utp23Q9CX11 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Utp23Q9CX11 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp23Q9CX11 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp23Q9CX11 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Utp23Q9CX11 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Utp23Q9CX11 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Utp23Q9CX11 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Utp23Q9CX11 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp23Q9CX11 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp23Q9CX11 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp23Q9CX11 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp23Q9CX11 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp23Q9CX11 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp23Q9CX11 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp23Q9CX11 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp23Q9CX11 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp23Q9CX11 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp23Q9CX11 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp23Q9CX11 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp23Q9CX11 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp23Q9CX11 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp23Q9CX11 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp23Q9CX11 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp23Q9CX11 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp23Q9CX11 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp23Q9CX11 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp23Q9CX11 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Utp23Q9CX11 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Utp23Q9CX11 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp23Q9CX11 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp23Q9CX11 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Utp23Q9CX11 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Utp23Q9CX11 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp23Q9CX11 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp23Q9CX11 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp23Q9CX11 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp23Q9CX11 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp23Q9CX11 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp23Q9CX11 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp23Q9CX11 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp23Q9CX11 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp23Q9CX11 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp23Q9CX11 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp23Q9CX11 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp23Q9CX11 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp23Q9CX11 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp23Q9CX11 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp23Q9CX11 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp23Q9CX11 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp23Q9CX11 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp23Q9CX11 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Utp23Q9CX11 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Utp23Q9CX11 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp23Q9CX11 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp23Q9CX11 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp23Q9CX11 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Utp23Q9CX11 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Utp23Q9CX11 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp23Q9CX11 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp23Q9CX11 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp23Q9CX11 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp23Q9CX11 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp23Q9CX11 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp23Q9CX11 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp23Q9CX11 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Utp23Q9CX11 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Utp23Q9CX11 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Utp23Q9CX11 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Utp23Q9CX11 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Utp23Q9CX11 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Utp23Q9CX11 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp23Q9CX11 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp23Q9CX11 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp23Q9CX11 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp23Q9CX11 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp23Q9CX11 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Utp23Q9CX11 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms