Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smc1aQ9CU62 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smc1aQ9CU62 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smc1aQ9CU62 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smc1aQ9CU62 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smc1aQ9CU62 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smc1aQ9CU62 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smc1aQ9CU62 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smc1aQ9CU62 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smc1aQ9CU62 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smc1aQ9CU62 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smc1aQ9CU62 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smc1aQ9CU62 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smc1aQ9CU62 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smc1aQ9CU62 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smc1aQ9CU62 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smc1aQ9CU62 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smc1aQ9CU62 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smc1aQ9CU62 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Smc1aQ9CU62 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smc1aQ9CU62 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Smc1aQ9CU62 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smc1aQ9CU62 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smc1aQ9CU62 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smc1aQ9CU62 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smc1aQ9CU62 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smc1aQ9CU62 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smc1aQ9CU62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smc1aQ9CU62 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smc1aQ9CU62 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smc1aQ9CU62 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smc1aQ9CU62 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smc1aQ9CU62 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smc1aQ9CU62 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smc1aQ9CU62 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Smc1aQ9CU62 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smc1aQ9CU62 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smc1aQ9CU62 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smc1aQ9CU62 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smc1aQ9CU62 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smc1aQ9CU62 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smc1aQ9CU62 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smc1aQ9CU62 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smc1aQ9CU62 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Smc1aQ9CU62 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smc1aQ9CU62 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smc1aQ9CU62 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smc1aQ9CU62 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smc1aQ9CU62 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smc1aQ9CU62 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smc1aQ9CU62 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smc1aQ9CU62 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smc1aQ9CU62 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smc1aQ9CU62 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smc1aQ9CU62 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smc1aQ9CU62 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smc1aQ9CU62 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smc1aQ9CU62 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smc1aQ9CU62 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smc1aQ9CU62 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smc1aQ9CU62 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smc1aQ9CU62 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smc1aQ9CU62 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smc1aQ9CU62 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smc1aQ9CU62 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smc1aQ9CU62 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smc1aQ9CU62 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smc1aQ9CU62 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smc1aQ9CU62 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smc1aQ9CU62 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smc1aQ9CU62 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smc1aQ9CU62 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smc1aQ9CU62 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smc1aQ9CU62 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smc1aQ9CU62 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smc1aQ9CU62 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smc1aQ9CU62 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smc1aQ9CU62 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smc1aQ9CU62 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smc1aQ9CU62 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smc1aQ9CU62 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smc1aQ9CU62 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Smc1aQ9CU62 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smc1aQ9CU62 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smc1aQ9CU62 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smc1aQ9CU62 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smc1aQ9CU62 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smc1aQ9CU62 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Smc1aQ9CU62 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smc1aQ9CU62 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smc1aQ9CU62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms