Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
4930550L24RikQ99PA7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
4930550L24RikQ99PA7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
4930550L24RikQ99PA7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
4930550L24RikQ99PA7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
4930550L24RikQ99PA7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
4930550L24RikQ99PA7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
4930550L24RikQ99PA7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
4930550L24RikQ99PA7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
4930550L24RikQ99PA7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
4930550L24RikQ99PA7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
4930550L24RikQ99PA7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
4930550L24RikQ99PA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
4930550L24RikQ99PA7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
4930550L24RikQ99PA7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
4930550L24RikQ99PA7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,24■■□□□ 1,95
4930550L24RikQ99PA7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
4930550L24RikQ99PA7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
4930550L24RikQ99PA7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,16■■□□□ 1,94
4930550L24RikQ99PA7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
4930550L24RikQ99PA7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
4930550L24RikQ99PA7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
4930550L24RikQ99PA7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,1■■□□□ 1,93
4930550L24RikQ99PA7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
4930550L24RikQ99PA7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
4930550L24RikQ99PA7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
4930550L24RikQ99PA7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
4930550L24RikQ99PA7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
4930550L24RikQ99PA7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
4930550L24RikQ99PA7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
4930550L24RikQ99PA7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
4930550L24RikQ99PA7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
4930550L24RikQ99PA7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
4930550L24RikQ99PA7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
4930550L24RikQ99PA7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,86■■□□□ 1,89
4930550L24RikQ99PA7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
4930550L24RikQ99PA7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
4930550L24RikQ99PA7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
4930550L24RikQ99PA7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
4930550L24RikQ99PA7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
4930550L24RikQ99PA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
4930550L24RikQ99PA7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,74■■□□□ 1,87
4930550L24RikQ99PA7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
4930550L24RikQ99PA7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
4930550L24RikQ99PA7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
4930550L24RikQ99PA7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
4930550L24RikQ99PA7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
4930550L24RikQ99PA7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
4930550L24RikQ99PA7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
4930550L24RikQ99PA7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
4930550L24RikQ99PA7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
4930550L24RikQ99PA7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
4930550L24RikQ99PA7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
4930550L24RikQ99PA7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
4930550L24RikQ99PA7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
4930550L24RikQ99PA7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
4930550L24RikQ99PA7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
4930550L24RikQ99PA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
4930550L24RikQ99PA7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
4930550L24RikQ99PA7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
4930550L24RikQ99PA7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
4930550L24RikQ99PA7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,46■■□□□ 1,83
4930550L24RikQ99PA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
4930550L24RikQ99PA7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
4930550L24RikQ99PA7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
4930550L24RikQ99PA7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,82
4930550L24RikQ99PA7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
4930550L24RikQ99PA7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
4930550L24RikQ99PA7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
4930550L24RikQ99PA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
4930550L24RikQ99PA7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
4930550L24RikQ99PA7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
4930550L24RikQ99PA7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
4930550L24RikQ99PA7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
4930550L24RikQ99PA7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
4930550L24RikQ99PA7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
4930550L24RikQ99PA7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
4930550L24RikQ99PA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
4930550L24RikQ99PA7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
4930550L24RikQ99PA7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
4930550L24RikQ99PA7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
4930550L24RikQ99PA7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
4930550L24RikQ99PA7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
4930550L24RikQ99PA7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
4930550L24RikQ99PA7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,21■■□□□ 1,79
4930550L24RikQ99PA7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
4930550L24RikQ99PA7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
4930550L24RikQ99PA7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,17■■□□□ 1,78
4930550L24RikQ99PA7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
4930550L24RikQ99PA7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
4930550L24RikQ99PA7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
4930550L24RikQ99PA7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
4930550L24RikQ99PA7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
4930550L24RikQ99PA7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
4930550L24RikQ99PA7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
4930550L24RikQ99PA7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms