Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nmd3Q99L48 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nmd3Q99L48 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nmd3Q99L48 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nmd3Q99L48 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nmd3Q99L48 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nmd3Q99L48 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nmd3Q99L48 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nmd3Q99L48 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nmd3Q99L48 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nmd3Q99L48 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nmd3Q99L48 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nmd3Q99L48 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nmd3Q99L48 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nmd3Q99L48 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nmd3Q99L48 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nmd3Q99L48 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nmd3Q99L48 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nmd3Q99L48 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nmd3Q99L48 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nmd3Q99L48 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nmd3Q99L48 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nmd3Q99L48 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nmd3Q99L48 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nmd3Q99L48 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nmd3Q99L48 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nmd3Q99L48 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nmd3Q99L48 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nmd3Q99L48 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nmd3Q99L48 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nmd3Q99L48 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nmd3Q99L48 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nmd3Q99L48 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nmd3Q99L48 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nmd3Q99L48 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nmd3Q99L48 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nmd3Q99L48 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nmd3Q99L48 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nmd3Q99L48 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nmd3Q99L48 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nmd3Q99L48 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nmd3Q99L48 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nmd3Q99L48 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nmd3Q99L48 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nmd3Q99L48 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nmd3Q99L48 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nmd3Q99L48 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nmd3Q99L48 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nmd3Q99L48 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nmd3Q99L48 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nmd3Q99L48 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nmd3Q99L48 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nmd3Q99L48 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nmd3Q99L48 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nmd3Q99L48 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nmd3Q99L48 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nmd3Q99L48 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nmd3Q99L48 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nmd3Q99L48 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nmd3Q99L48 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nmd3Q99L48 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nmd3Q99L48 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nmd3Q99L48 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nmd3Q99L48 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nmd3Q99L48 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nmd3Q99L48 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nmd3Q99L48 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nmd3Q99L48 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nmd3Q99L48 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nmd3Q99L48 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nmd3Q99L48 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nmd3Q99L48 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nmd3Q99L48 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nmd3Q99L48 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nmd3Q99L48 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nmd3Q99L48 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nmd3Q99L48 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nmd3Q99L48 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nmd3Q99L48 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nmd3Q99L48 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nmd3Q99L48 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nmd3Q99L48 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms