Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Trim66Q924W6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Trim66Q924W6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Trim66Q924W6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Trim66Q924W6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Trim66Q924W6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Trim66Q924W6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Trim66Q924W6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Trim66Q924W6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Trim66Q924W6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Trim66Q924W6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Trim66Q924W6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Trim66Q924W6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Trim66Q924W6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Trim66Q924W6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Trim66Q924W6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Trim66Q924W6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Trim66Q924W6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Trim66Q924W6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Trim66Q924W6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Trim66Q924W6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Trim66Q924W6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Trim66Q924W6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Trim66Q924W6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Trim66Q924W6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Trim66Q924W6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Trim66Q924W6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Trim66Q924W6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Trim66Q924W6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Trim66Q924W6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trim66Q924W6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Trim66Q924W6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Trim66Q924W6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim66Q924W6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim66Q924W6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim66Q924W6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Trim66Q924W6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Trim66Q924W6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim66Q924W6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trim66Q924W6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim66Q924W6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Trim66Q924W6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Trim66Q924W6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Trim66Q924W6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim66Q924W6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim66Q924W6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim66Q924W6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim66Q924W6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Trim66Q924W6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Trim66Q924W6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Trim66Q924W6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Trim66Q924W6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim66Q924W6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim66Q924W6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim66Q924W6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim66Q924W6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim66Q924W6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Trim66Q924W6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Trim66Q924W6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Trim66Q924W6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Trim66Q924W6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Trim66Q924W6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Trim66Q924W6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Trim66Q924W6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Trim66Q924W6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Trim66Q924W6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Trim66Q924W6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Trim66Q924W6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Trim66Q924W6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Trim66Q924W6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Trim66Q924W6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Trim66Q924W6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Trim66Q924W6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim66Q924W6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim66Q924W6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Trim66Q924W6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Trim66Q924W6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Trim66Q924W6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Trim66Q924W6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Trim66Q924W6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Trim66Q924W6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Trim66Q924W6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Trim66Q924W6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Trim66Q924W6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Trim66Q924W6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Trim66Q924W6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Trim66Q924W6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,95■■□□□ 1,91
Trim66Q924W6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Trim66Q924W6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Trim66Q924W6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Trim66Q924W6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms