Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim66Q924W6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim66Q924W6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim66Q924W6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim66Q924W6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim66Q924W6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim66Q924W6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim66Q924W6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim66Q924W6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim66Q924W6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim66Q924W6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim66Q924W6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim66Q924W6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim66Q924W6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim66Q924W6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim66Q924W6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim66Q924W6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim66Q924W6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim66Q924W6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim66Q924W6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim66Q924W6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim66Q924W6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim66Q924W6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim66Q924W6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim66Q924W6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim66Q924W6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim66Q924W6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim66Q924W6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim66Q924W6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim66Q924W6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim66Q924W6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim66Q924W6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim66Q924W6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim66Q924W6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim66Q924W6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim66Q924W6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim66Q924W6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim66Q924W6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim66Q924W6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim66Q924W6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim66Q924W6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim66Q924W6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim66Q924W6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim66Q924W6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim66Q924W6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim66Q924W6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim66Q924W6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim66Q924W6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim66Q924W6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim66Q924W6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim66Q924W6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim66Q924W6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim66Q924W6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim66Q924W6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim66Q924W6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim66Q924W6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim66Q924W6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim66Q924W6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim66Q924W6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim66Q924W6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim66Q924W6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim66Q924W6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim66Q924W6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim66Q924W6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim66Q924W6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim66Q924W6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim66Q924W6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim66Q924W6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim66Q924W6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim66Q924W6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim66Q924W6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim66Q924W6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim66Q924W6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim66Q924W6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim66Q924W6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim66Q924W6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim66Q924W6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim66Q924W6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim66Q924W6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim66Q924W6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim66Q924W6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim66Q924W6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim66Q924W6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim66Q924W6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim66Q924W6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim66Q924W6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim66Q924W6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim66Q924W6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim66Q924W6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim66Q924W6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim66Q924W6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim66Q924W6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms