Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh10Q8VCH7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdh10Q8VCH7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rdh10Q8VCH7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdh10Q8VCH7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh10Q8VCH7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdh10Q8VCH7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh10Q8VCH7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh10Q8VCH7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh10Q8VCH7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdh10Q8VCH7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh10Q8VCH7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdh10Q8VCH7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdh10Q8VCH7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdh10Q8VCH7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdh10Q8VCH7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdh10Q8VCH7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdh10Q8VCH7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdh10Q8VCH7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdh10Q8VCH7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdh10Q8VCH7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh10Q8VCH7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdh10Q8VCH7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdh10Q8VCH7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdh10Q8VCH7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdh10Q8VCH7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh10Q8VCH7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh10Q8VCH7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdh10Q8VCH7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdh10Q8VCH7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdh10Q8VCH7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdh10Q8VCH7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdh10Q8VCH7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdh10Q8VCH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh10Q8VCH7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh10Q8VCH7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh10Q8VCH7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh10Q8VCH7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdh10Q8VCH7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh10Q8VCH7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh10Q8VCH7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh10Q8VCH7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdh10Q8VCH7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh10Q8VCH7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdh10Q8VCH7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdh10Q8VCH7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh10Q8VCH7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh10Q8VCH7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh10Q8VCH7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh10Q8VCH7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh10Q8VCH7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh10Q8VCH7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh10Q8VCH7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh10Q8VCH7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh10Q8VCH7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh10Q8VCH7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rdh10Q8VCH7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh10Q8VCH7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh10Q8VCH7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh10Q8VCH7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh10Q8VCH7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh10Q8VCH7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh10Q8VCH7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh10Q8VCH7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh10Q8VCH7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh10Q8VCH7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh10Q8VCH7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh10Q8VCH7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh10Q8VCH7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh10Q8VCH7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh10Q8VCH7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms