Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gle1Q8R322 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gle1Q8R322 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gle1Q8R322 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gle1Q8R322 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gle1Q8R322 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gle1Q8R322 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gle1Q8R322 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gle1Q8R322 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gle1Q8R322 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gle1Q8R322 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gle1Q8R322 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gle1Q8R322 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gle1Q8R322 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gle1Q8R322 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gle1Q8R322 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gle1Q8R322 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gle1Q8R322 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gle1Q8R322 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gle1Q8R322 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gle1Q8R322 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gle1Q8R322 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gle1Q8R322 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gle1Q8R322 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gle1Q8R322 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gle1Q8R322 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gle1Q8R322 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gle1Q8R322 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gle1Q8R322 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gle1Q8R322 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gle1Q8R322 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gle1Q8R322 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gle1Q8R322 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gle1Q8R322 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gle1Q8R322 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gle1Q8R322 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gle1Q8R322 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gle1Q8R322 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gle1Q8R322 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gle1Q8R322 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gle1Q8R322 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gle1Q8R322 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gle1Q8R322 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gle1Q8R322 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gle1Q8R322 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gle1Q8R322 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gle1Q8R322 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gle1Q8R322 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gle1Q8R322 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gle1Q8R322 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gle1Q8R322 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gle1Q8R322 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gle1Q8R322 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gle1Q8R322 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gle1Q8R322 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gle1Q8R322 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gle1Q8R322 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gle1Q8R322 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gle1Q8R322 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gle1Q8R322 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gle1Q8R322 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gle1Q8R322 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gle1Q8R322 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gle1Q8R322 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gle1Q8R322 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gle1Q8R322 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gle1Q8R322 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gle1Q8R322 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gle1Q8R322 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gle1Q8R322 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gle1Q8R322 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gle1Q8R322 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gle1Q8R322 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gle1Q8R322 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gle1Q8R322 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gle1Q8R322 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gle1Q8R322 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gle1Q8R322 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gle1Q8R322 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gle1Q8R322 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gle1Q8R322 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gle1Q8R322 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Gle1Q8R322 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gle1Q8R322 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gle1Q8R322 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gle1Q8R322 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gle1Q8R322 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gle1Q8R322 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gle1Q8R322 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gle1Q8R322 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gle1Q8R322 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gle1Q8R322 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms