Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2I4

Defb13, Beta-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb13Q8R2I4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defb13Q8R2I4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defb13Q8R2I4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defb13Q8R2I4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb13Q8R2I4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defb13Q8R2I4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16,17■□□□□ 0,18
Defb13Q8R2I4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defb13Q8R2I4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16,13■□□□□ 0,17
Defb13Q8R2I4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defb13Q8R2I4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defb13Q8R2I4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defb13Q8R2I4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defb13Q8R2I4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Defb13Q8R2I4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Defb13Q8R2I4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,07■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16,03■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16,03■□□□□ 0,16
Defb13Q8R2I4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16,02■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Defb13Q8R2I4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,14
Defb13Q8R2I4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
Defb13Q8R2I4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Defb13Q8R2I4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Defb13Q8R2I4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Defb13Q8R2I4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,92■□□□□ 0,14
Defb13Q8R2I4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC15,91■□□□□ 0,14
Defb13Q8R2I4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Defb13Q8R2I4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Defb13Q8R2I4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Defb13Q8R2I4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Defb13Q8R2I4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Defb13Q8R2I4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,13
Defb13Q8R2I4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defb13Q8R2I4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defb13Q8R2I4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defb13Q8R2I4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Defb13Q8R2I4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Defb13Q8R2I4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Defb13Q8R2I4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Defb13Q8R2I4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,75■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Defb13Q8R2I4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Defb13Q8R2I4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Defb13Q8R2I4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Defb13Q8R2I4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defb13Q8R2I4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defb13Q8R2I4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Defb13Q8R2I4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,64■□□□□ 0,09
Defb13Q8R2I4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Defb13Q8R2I4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,6■□□□□ 0,09
Defb13Q8R2I4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Defb13Q8R2I4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Defb13Q8R2I4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15,52■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15,49■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15,47■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Defb13Q8R2I4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,06
Defb13Q8R2I4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15,45■□□□□ 0,06
Defb13Q8R2I4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Defb13Q8R2I4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15,45■□□□□ 0,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,2 ms