Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3D6

Slc35e4, Solute carrier family 35 member E4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e4Q8K3D6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc35e4Q8K3D6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc35e4Q8K3D6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc35e4Q8K3D6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc35e4Q8K3D6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc35e4Q8K3D6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc35e4Q8K3D6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc35e4Q8K3D6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35e4Q8K3D6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc35e4Q8K3D6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc35e4Q8K3D6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35e4Q8K3D6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35e4Q8K3D6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35e4Q8K3D6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35e4Q8K3D6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35e4Q8K3D6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35e4Q8K3D6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35e4Q8K3D6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35e4Q8K3D6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35e4Q8K3D6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc35e4Q8K3D6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35e4Q8K3D6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35e4Q8K3D6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35e4Q8K3D6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc35e4Q8K3D6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc35e4Q8K3D6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35e4Q8K3D6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc35e4Q8K3D6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc35e4Q8K3D6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc35e4Q8K3D6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc35e4Q8K3D6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc35e4Q8K3D6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc35e4Q8K3D6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc35e4Q8K3D6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35e4Q8K3D6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35e4Q8K3D6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc35e4Q8K3D6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc35e4Q8K3D6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35e4Q8K3D6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35e4Q8K3D6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc35e4Q8K3D6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc35e4Q8K3D6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc35e4Q8K3D6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc35e4Q8K3D6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc35e4Q8K3D6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc35e4Q8K3D6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc35e4Q8K3D6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc35e4Q8K3D6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc35e4Q8K3D6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc35e4Q8K3D6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc35e4Q8K3D6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc35e4Q8K3D6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc35e4Q8K3D6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc35e4Q8K3D6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc35e4Q8K3D6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc35e4Q8K3D6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35e4Q8K3D6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35e4Q8K3D6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc35e4Q8K3D6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc35e4Q8K3D6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc35e4Q8K3D6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc35e4Q8K3D6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc35e4Q8K3D6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc35e4Q8K3D6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc35e4Q8K3D6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc35e4Q8K3D6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc35e4Q8K3D6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc35e4Q8K3D6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc35e4Q8K3D6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc35e4Q8K3D6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc35e4Q8K3D6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc35e4Q8K3D6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc35e4Q8K3D6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc35e4Q8K3D6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc35e4Q8K3D6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc35e4Q8K3D6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc35e4Q8K3D6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc35e4Q8K3D6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc35e4Q8K3D6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc35e4Q8K3D6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc35e4Q8K3D6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc35e4Q8K3D6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms