Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pnpt1Q8K1R3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pnpt1Q8K1R3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pnpt1Q8K1R3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pnpt1Q8K1R3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pnpt1Q8K1R3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pnpt1Q8K1R3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pnpt1Q8K1R3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pnpt1Q8K1R3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pnpt1Q8K1R3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pnpt1Q8K1R3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pnpt1Q8K1R3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pnpt1Q8K1R3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pnpt1Q8K1R3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pnpt1Q8K1R3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pnpt1Q8K1R3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pnpt1Q8K1R3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pnpt1Q8K1R3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pnpt1Q8K1R3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pnpt1Q8K1R3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pnpt1Q8K1R3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pnpt1Q8K1R3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pnpt1Q8K1R3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pnpt1Q8K1R3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pnpt1Q8K1R3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pnpt1Q8K1R3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pnpt1Q8K1R3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pnpt1Q8K1R3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pnpt1Q8K1R3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pnpt1Q8K1R3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pnpt1Q8K1R3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pnpt1Q8K1R3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pnpt1Q8K1R3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pnpt1Q8K1R3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pnpt1Q8K1R3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pnpt1Q8K1R3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pnpt1Q8K1R3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pnpt1Q8K1R3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pnpt1Q8K1R3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pnpt1Q8K1R3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pnpt1Q8K1R3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pnpt1Q8K1R3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pnpt1Q8K1R3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pnpt1Q8K1R3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pnpt1Q8K1R3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pnpt1Q8K1R3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pnpt1Q8K1R3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pnpt1Q8K1R3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pnpt1Q8K1R3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pnpt1Q8K1R3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnpt1Q8K1R3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnpt1Q8K1R3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pnpt1Q8K1R3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pnpt1Q8K1R3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pnpt1Q8K1R3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pnpt1Q8K1R3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnpt1Q8K1R3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pnpt1Q8K1R3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnpt1Q8K1R3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pnpt1Q8K1R3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pnpt1Q8K1R3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pnpt1Q8K1R3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pnpt1Q8K1R3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnpt1Q8K1R3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnpt1Q8K1R3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnpt1Q8K1R3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnpt1Q8K1R3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnpt1Q8K1R3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pnpt1Q8K1R3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pnpt1Q8K1R3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pnpt1Q8K1R3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pnpt1Q8K1R3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pnpt1Q8K1R3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pnpt1Q8K1R3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pnpt1Q8K1R3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pnpt1Q8K1R3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pnpt1Q8K1R3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pnpt1Q8K1R3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Pnpt1Q8K1R3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pnpt1Q8K1R3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpt1Q8K1R3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpt1Q8K1R3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pnpt1Q8K1R3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpt1Q8K1R3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpt1Q8K1R3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpt1Q8K1R3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnpt1Q8K1R3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pnpt1Q8K1R3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pnpt1Q8K1R3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pnpt1Q8K1R3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnpt1Q8K1R3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnpt1Q8K1R3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnpt1Q8K1R3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnpt1Q8K1R3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnpt1Q8K1R3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pnpt1Q8K1R3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pnpt1Q8K1R3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnpt1Q8K1R3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnpt1Q8K1R3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms